讲述日本海洋研究开发机构「JAMSTEC」的潜水调查船「深海6500」，天谷深雪（有村架纯）属於当中的调查队，她的父亲厚志是驾驶员陈源退一步，这条巨蟒就向前游一点，陈源退两步，它就向前又游一点，总之，是紧紧地跟着陈源，步步紧逼。陈源看出了这一点，但陈源还是在向后退着，不是不敢停下来和它正面硬抗，而是楼梯口的空间太狭小了，不利于他闪避。兼研究者，她小时候听到父亲有关深海的事後，决定以探索海洋为目标，在她的父亲病死後，深雪以驾驶员候补生身份每日工作着。某天她有机会乘上「深海6500」，而JAMSTEC也大力宣传首个日本女性驾驶员诞生，然而在潜航前深雪在父亲的储物柜发现一盒录影带，内有看到深海未知巨大生物的船员的恐怖影像，也有她父亲最後的身影，之後恐怖真的袭来，深雪能否从黑暗的深海安全回来？
